В юбилейном пятом конкурсе «Музей года», объявленном в 2006 г., приняло участие наибольшее за всю историю проведения конкурса количество музеев.

Среди музеев, подавших заявку на участие и представивших документы на рассмотрение Экспертного Совета – Национальный центр сямозерских карел «Сямозерье», Культурно-музейный центр г.Костомукша, Региональный музей Северного Приладожья, Сегежский музейный центр, Куркиекский краеведческий центр, Пудожский историко-краеведческий музей им. А.Ф.Кораблева, Кондопожский городской музей, Кемский городской музей «Поморье», Олонецкий национальный музей карелов-ливвиков им. Н.Г.Прилукина, Медвежьегорский районный музей, Шелтозерский вепсский этнографический музей, Калевальский национальный краеведческий музей.

Экспертный Совет определил победителей в восьми номинациях:
• «Экспозиция года»
Кемский городской музей «Поморье» – экспозиция “Море-наше поле” (о промысле, мореходстве и быте кемских поморов).
• «Музейно-образовательная программа года»
Кондопожский городской музей – «Чудеса из карельского леса» (музейно-образовательная программа для детей дошкольного и школьного возраста на базе выставки «Лес-наше богатство»).
• «Издание года»
Олонецкий национальный музей карелов-ливвиков им. Н.Г. Прилукина – «Есть только миг»: сборник материалов об олончанах – ветеранах Великой Отечественной войны, 1941-1945 гг.
• «Туристский маршрут года»
Культурно-музейный центр г. Костомукша – «Калевальская кругосветка» (автобусное путешествие по Беломорской Карелии).
• «Коллекция года»
Медвежьегорский районный музей – «Личный архив учителя Дмитрия Макаровича Пономарева (1930-ые гг.)»
• «Исследование года»
Калевальский национальный музей – исследование «Финляндские путешественники в Беломорской Карелии в XIX веке».
• «Событие года»
Региональный музей Северного Приладожья Сортавальского муниципального района – юбилейная выставка Н.К.Рериха «Гималаи» и Олонецкий национальный музей карелов-ливвиков им. Н.Г. Прилукина – фестиваль национального костюма «Ferezi»
• «Электронный ресурс года»
Шелтозерский вепсский этнографический музей – база данных фондовых коллекций Шелтозерского вепсского этнографического музея

Музеи, победившие в номинациях, получили дипломы конкурса.

Победителем традиционного конкурса партнерских музейных проектов, получившим финансирование на его реализацию, стал Калевальский национальный краеведческий музей (проект создания в Музее рунопевцев фольклорной экспозиции «Рун неспешное сказание»).
Победителем конкурса «Музей года - 2006» объявлен Олонецкий национальный музей карелов-ливвиков им. Н.Г.Прилукина (директор Николаева Н.В.), получивший звание лучшего музея во второй раз.